Медресе Барак-хана было построено в XVI веке во времена правления Суиндж-хана, внука Улугбека. Медресе представляет собой целый комплекс, включающих само медресе и два мавзолея. Самым раним строением считается мавзолей, располагающийся по левую сторону комплекса и называется Безымянным, потому что в мавзолее захоронено неизвестное духовное лицо.
Рядом с ним был построен мавзолей для самого Суиндж-хана. И только после постройки двух мавзолеев, было пристроено медресе, которое впоследствии и стало как бы центральным строением всего комплекса. Медресе построено из рваного кирпича в форме трапеции. Фасад украшен майоликой и кирпичной мозаикой, а по углам фасада располагаются башни, увенчанные куполами. Во внутреннем дворе расположились худжры – кельи учеников.
Суинжд-хан, прозванный Барак-ханом был младшим сыном и принадлежал династии Шейбанидов. После смерти его отца в 1551 году, он стал правителем Ташкента. В юные годы Барак-хан изучал поэзию и музыку и его наставником был знаменитый персидско-турецкий поэт Восифий. Большинство времени, Барак-хан посвящал верховой езде и военной службе.
После смерти Абдуллатиф-хана, Барак-хан воцарился в Самарканде и тогда его стали называть Навруз Ахмадшох. Во времена его правления, было построено много медресе и были развиты торговля и дипломатические отношения между странами Ближнего Востока. Барак-хан умер в Самарканде, где и был погребен.
Медресе было отреставрировано в конце XIX века и при правлении СССР использовалось в разных целях, например в медресе долгое время торговали керосином. Также медресе служило пристанищем для семей слепых. В середине XX века, в медресе находилось Духовное Управление Мусульман Средней Азии вплоть до начала XXI века. На сегодняшний день, в кельях медресе располагаются мастерские местных ремесленников, где вы сможете приобрести разнообразные национальные сувениры и понаблюдать за работой искусных мастеров.